Hace un poco más de un año Víctor Manuel Vucetich llego el 13 de Agosto a tomar la dirección técnica de las Chivas de Guadalajara, tras el despido de Luis Fernando Tena y una corta dirección interna de Marcelo Michel Leaño. Su camino como DT del rebaño, comenzó desde la jornada numero cinco.

En el torneo del apertura 2020, consiguió meter al equipo del Guadalajara al séptimo lugar, consiguiendo boleto a la reclasificación. en los partidos más importantes de la temporada de Chivas, que son contra América y Atlas, perdió por la mínima en el Azteca y gano 3 a 2 al Atlas. En el partido reclasificatorio se enfrento al Necaxa pasando a la siguiente ronda por la mínima, en cuartos de final se enfrentaría al América donde en ambos partidos ganaría, que lo llevaron a las semis donde enfrentaría al León pero que no pudo avanzar a la gran final.

Para el torneo del Clausura 2021, clasificaría a las Chivas en el lugar numero 9 de la tabla donde jugarían una vez más la reclasificación. En sus partidos contra sus rivales principales, perdería por 3 a 0 contra el América y ganaría por la mínima al Atlas. Pero para este torneo se quedaría en el camino reclasificatorio tras perder 4 a 2 contra Pachuca. En el Apertura 2021 tras 9 jornadas dejaría a las Chivas en el lugar noveno de la tabla, con trece puntos a su favor.

Su camino con las Chivas de Guadalajara tendría 45 partidos dirigidos donde ganaría y empataría 17 juegos, mientras que perdería 11 partidos.